Теоретична химия — определение, изчислителни методи и квантова химия
Теоретичната химия се опитва да обясни данните от химичните експерименти. Тя използва математически и изчислителен анализ. Теоретичната химия предсказва какво се случва, когато атомите се комбинират, за да образуват молекули. Тя също така предсказва химичните свойства (характеристики) на молекулите. Важна част от теоретичната химия е квантовата химия.
Какво представлява теоретичната химия
Теоретичната химия е дисциплина, която формализира химичните наблюдения чрез математически модели и компютърни симулации. Целта ѝ е не само да обяснява вече получени резултати, но и да предсказва нови свойства, реакционни пътища и материали преди експерименталната им проверка. Често тя служи като връзка между фундаменталните физични закони и практическите експерименти в лабораторията.
Квантова химия — основни понятия
Квантовата химия описва електронната структура на атомите и молекулите, използвайки уравнението на Шрьодингер и принципите на квантовата механика. Някои ключови понятия:
- Борн–Опенхаймер аппроксимация — разделя движението на ядрата и електроните, което опростява изчисленията.
- Вълнови функции и орбитали — математически функции, описващи вероятността за намиране на електрон.
- Плътност на електроните — алтернатива на вълновата функция; основа на теорията на функционала на плътността (DFT).
- Основни аппроксимации — използват се, за да направят задачите изчислими: ограничени базисни множества, методи за корелация и др.
Изчислителни методи — от първи принципи до емпирични модели
Съществуват различни класове методи, които се различават по точност и изчислителна сложност:
- Ab initio методи (от първи принципи) — като Hartree–Fock (HF) и последващи корелационни методи (MP2, CCSD, CCSD(T)). Дават висока точност, но са скъпи компютърно.
- Плътностна функционална теория (DFT) — балансира точност и скорост чрез използване на функционали за обмен и корелация (LDA, GGA, хибридни функционали). Широко използвана в изследвания на вещества и реакции.
- Полуемпирични методи (PMx, AM1) — опростени версии на квантовите методи, подходящи за големи системи, но с по-ниска точност.
- Молекулна механика (force fields) — моделира молекулите чрез класически потенциали (MMFF, OPLS, CHARMM). Подходяща за големи биомолекули и дълги симулации на молекулна динамика.
- QM/MM смеси — комбинират квантови и класически методи (квантова област около реактивното място и механична за останалата система), използвани при изследване на ензимни реакции и катализа.
Практически елементи
- Базисни множества — набор от функции, използвани за изграждане на орбиталите (напр. STO-3G, 6-31G(d), cc-pVDZ). По-големите базисни множества дават по-точни резултати, но изискват повече ресурси.
- Потенциални енергийни повърхности (PES) — карта на енергията като функция от атомните координати; важна за изучаване на структури, преходни състояния и механизми на реакции.
- Виртуални спектри — теоретичните методи позволяват пресмятане на IR, NMR, UV-Vis и други спектри, което помага при интерпретация на експерименти.
Приложения на теоретичната и квантовата химия
Примери за практически приложения:
- Предсказване и оптимизация на структури и енергии на молекули и материали.
- Изследване на механизми на химични реакции и намиране на преходни състояния.
- Симулация на спектрални данни за подпомагане на експерименталната интерпретация.
- Дизайн на лекарства и оптимизация на взаимодействия лигант–цели (липофилност, конформация, енергия на свързване).
- Разработване на нови катализатори, полупроводници и функционални материали.
Ограничения и предизвикателства
Въпреки напредъка, има важни ограничения:
- Изчислителната сложност расте бързо с размера на система — много точните методи не са приложими за много големи молекули.
- Аппроксимациите (тип базисно множество, функционал в DFT) могат да водят до систематични грешки.
- Релаивистичните ефекти са важни за тежки елементи и изискват специални корекции.
- Влиянието на средата (разтворител, температура, динамични ефекти) често изисква допълнителни модели и дълги симулации.
Често използван софтуер и работен поток
Популярни пакети за квантовохимични и изчислителни симулации: Gaussian, ORCA, NWChem, GAMESS, VASP, CP2K и други. Общ работен поток включва:
- Конструиране на начална геометрия
- Оптимизация на структура и пресмятане на енергии
- Изследване на честотите (за проверка на минимуми/преходни състояния)
- Симулация на спектри или термодинамични величини
- Сравнение с експериментални данни и подобряване на модела при необходимост
Теоретичната химия е динамично поле, което постоянно се развива благодарение на подобрения в алгоритмите, изчислителната мощ и моделирането. Тя дава мощни инструменти за разбиране и откриване в химията, но изисква внимателно приложение и валидация спрямо експерименталните данни.
Преглед
Теоретичните химици използват широк набор от инструменти. Тези инструменти включват аналитични модели (например LCAO-MOs за апроксимиране на поведението на електроните в молекулите) и изчислителни и числени симулации.
Теоретиците в областта на химията създават теоретични модели. След това те откриват неща, които химиците експериментатори могат да измерят на базата на тези модели. Това помага на химиците да търсят данни, които могат да докажат, че даден модел не е верен. Данните помагат да се избере между няколко различни или противоположни модела.
Теоретиците също се опитват да създадат или модифицират модели, които да съответстват на всички нови данни, Ако данните не могат да съответстват на модела, химиците се опитват да направят най-малката промяна в модела, за да съответстват на данните. В някои случаи химиците изхвърлят даден модел, ако с течение на времето много данни не се вписват в него.
Теоретичната химия използва физиката, за да обясни или предвиди химичните наблюдения. През последните години тя се занимава основно с квантова химия (прилагане на квантовата механика към проблеми в химията). Основните части на теоретичната химия са електронна структура, динамика и статистическа механика.
Всички тези области се използват в процеса на прогнозиране на химичната реактивност. Други, не толкова централни изследователски области, включват математическото описание на обемната химия в различни фази. Теоретичните химици искат да обяснят химичната кинетика (пътя, по който молекулите се комбинират).
Учените наричат голяма част от тази работа "изчислителна химия". Изчислителната химия обикновено използва теоретичната химия за решаване на промишлени и практически проблеми. Примери за изчислителна химия са проектите за апроксимиране на химични измервания, като например някои видове пост Хартри-Фок, функционална теория на плътността, полуемпирични методи (като PM3) или методи на силовите полета. Някои химични теоретици използват статистическата механика, за да създадат връзка между микроскопичните явления на квантовия свят и макроскопичните обемни свойства на системите.
Основни области на теоретичната химия
Квантова химия
Прилагане на квантовата механика в химията
Прилагане на компютърни кодове в химията
Молекулярно моделиране
Методи за моделиране на молекулярни структури, без да е необходимо да се използва квантовата механика. Примери за това са молекулярният докинг, докингът протеин-протеин, дизайнът на лекарства, комбинаторната химия.
Молекулярна динамика
Прилагане на класическата механика за симулиране на движението на ядрата на сбор от атоми и молекули.
Молекулярна механика
Моделиране на потенциалните енергийни повърхности на вътрешно и междумолекулно взаимодействие чрез сума от сили на взаимодействие.
Математическа химия
Обсъждане и прогнозиране на молекулярната структура с помощта на математически методи, без да е задължително да се прави позоваване на квантовата механика.
Теоретична химична кинетика
Теоретично изследване на динамичните системи, свързани с реактивни химикали, и съответните им диференциални уравнения.
Химическа информатика (известна също като химическа информатика)
Използване на компютърни и информационни техники, приложени към редица проблеми в областта на химията.
Свързани страници
В миналото изследователите са използвали теоретичната химия за изучаване на:
- Атомна физика: електрони и атомни ядра.
- Молекулярна физика: електроните, обграждащи молекулните ядра, и движението на ядрата. Този термин обикновено се отнася до изучаването на молекули, съставени от няколко атома в газова фаза. Но някои смятат, че молекулярната физика е и изучаване на обемните свойства на химичните вещества по отношение на молекулите.
- Физична химия и химична физика: използване на физични методи като лазерни техники, сканиращ тунелен микроскоп и др. Формалното разграничение между двете области е, че физикохимията е клон на химията, докато химичната физика е клон на физиката. Това не е ясна разлика.
- Теория на многото тела: ефектите, които се проявяват в системи с голям брой съставни части. Тя се основава на квантовата физика - най-вече на формализма на второто квантуване - и на квантовата електродинамика.
Още четене
- Атила Сабо и Нийл С. Остлунд, Съвременна квантова химия: Въведение в съвременната теория на електронната структура, Dover Publications; ново издание (1996 г.) ISBN 0486691861, ISBN 978-0486691862
- Robert G. Parr and Weitao Yang, Density-Functional Theory of Atoms and Molecules (Теория на функциите на плътността на атомите и молекулите), Oxford Science Publications; публикувана за първи път през 1989 г.; ISBN 0-19-504279-4, ISBN 0-19-509276-7
Химия |
Аналитична химия - Биохимия - Бионеорганична химия - Биоорганична химия - Биофизична химия - Химична биология - Химична физика - Химическо образование - Изчислителна химия - Електрохимия - Химия на околната среда - Зелена химия - Неорганична химия - Материалознание - Фармацевтична химия - Ядрена химия - Органична химия - Органометална химия - Фармация - Физична химия - Фотохимия - Полимерна химия - Химия на твърдото тяло - Супрамолекулярна химия - Теоретична химия - Термохимия - Мокра химия |
Списък на биомолекулите - Списък на неорганичните съединения - Списък на органичните съединения - Периодична таблица |
Контрол от страна на органа: Национални библиотеки |
|
Въпроси и отговори
В: Какво е теоретична химия?
О: Теоретичната химия е клон на науката, който използва математика и компютърен анализ, за да обясни данните от химични експерименти, да предвиди какво се случва, когато атомите се комбинират, за да образуват молекули, и да предскаже химичните свойства на молекулите.
В: Какъв вид анализ се използва?
О: Теоретичната химия използва математически и изчислителен анализ.
В: Как помага да се обяснят данните от химични експерименти?
О: Теоретичната химия се опитва да обясни данните от химични експерименти, като използва математика и изчислителен анализ.
В: Какво може да предскаже за атомите, които се комбинират, за да образуват молекули?
О: Теоретичната химия може да предскаже какво се случва, когато атомите се комбинират, за да образуват молекули.
В: Какви прогнози прави за химичните свойства на молекулите?
О: Теоретичната химия предсказва химичните свойства (характеристики) на молекулите.
В: Квантовата химия важна част от теоретичната химия ли е?
О: Да, квантовата химия е важна част от теоретичната химия.