HUGO Gene Nomenclature Committee

Комитетът за номенклатура на гените HUGO (HGNC) определя уникално и значимо име за всеки известен човешки ген. Той се допитва до мнението на експертите. HGNC дава дълго име и съкращение (наричано символ) на всеки ген. HGNC е част от Организацията за човешкия геном (HUGO).

Традиционните имена и съкращения на гени често не са специфични за един ген. Пример: CAP (което означава просто "хромозомно-асоцииран протеин") може да се отнася за някой от шест различни гена: (BRD4, CAP1, LNPEP, PTPLA, SERPINB6 и SORBS1).

За разлика от традиционните наименования като CAP, кратките имена на гени или генните символи на HGNC се дават само на един ген. Това намалява объркването по отношение на това за кой ген се отнася.

Указания за именуване

Подходът на HGNC за именуване на гени и присвояване на символи (съкращения на имена на гени) е:

генните символи трябва да са уникални
символите трябва да използват само латинската азбука и арабските цифри.
символите не трябва да съдържат препинателни знаци или "G" за ген
символите не съдържат никаква препратка към вида, в който са кодирани, т.е. "H/h" за човек

Пълното описание на насоките за номенклатура на HGNC може да бъде намерено на техния уебсайт [2]. HGNC препоръчва добавките _v1, _v2,... за разграничаване на различните варианти на сплайс и _pr1, _pr2,... за варианти на промотора на един ген.

HGNC също така заявява, че "генната номенклатура трябва да се развива заедно с новите технологии, а не да бъде ограничаваща, както понякога се случва, когато се прилагат исторически и единични генни номенклатурни системи".

Процедура

HGNC се свързва с авторите, които са публикували данни за въпросния човешки ген, по електронна поща. От тях се иска мнението им за предложената номенклатура. HGNC работи и с други куратори на бази данни, както и с експерти за конкретни генни семейства или групи гени.

Ревизия

Промяната на стандартизирано име на ген, след като то се е наложило, може да доведе до объркване. Поради това ползите от подобни промени са спорни. Поради тази причина HGNC променя името на гена само ако за тази промяна може да се получи съгласие от повечето изследователи, работещи върху този ген.

Свързани страници

Организация за човешкия геном (HUGO)
Проект за човешкия геном
човешки геном
ген
генна номенклатура

Въпроси и отговори

Въпрос: Каква е ролята на Комитета за номенклатура на гените на ХУГО (HGNC)?

О: HGNC определя уникално и значимо име за всеки известен човешки ген.

В: Как HGNC избира имената на гените?

О: HGNC иска мнението на експертите, преди да даде дълго име и съкращение на всеки ген.

Въпрос: Каква е абревиатурата на името, дадено на всеки ген от HGNC?

О: Съкращението се нарича символ.

В: Защо традиционните имена и съкращения на гени не са специфични за един ген?

О: Традиционните имена и съкращения на гени могат да се използват за обозначаване на множество различни гени, което води до объркване.

Въпрос: Колко генни символа са дадени на всеки ген от HGNC?

О: Кратките имена на гени или генните символи на HGNC се дават само на един ген.

В: Каква е ползата от използването на генни символи на HGNC вместо традиционните генни имена?

О: Използването на генните символи на HGNC намалява объркването по отношение на това за кой ген става дума.

В: От коя организация е част HGNC?

О: HGNC е част от Организацията за човешкия геном (HUGO).